Sujet de stage
Titre :
Intérêt de l'étude des profils génomiques des cancers gastro-oesophagiens sur la réponse à la chimiothérapie
Dates :
2024/01/10 - 2024/06/21
Etudiant :
Encadrant(s) :
Description :
Le cancer de l'oesophage est le 7ème cancer le plus important en termes d'incidence, et le 6ème en termes de mortalité dans le monde.
Environ 70 % des cas concernent les hommes : il existe un facteur 2 (incidence) et 3 (mortalité) entre les deux sexes.
L'adénocarcinome constitue aujourd'hui les deux tiers des cancers oesophagiens (contre un tiers pour les carcinomes à cellules
squameuses).
L'étude PRODIGE 68 REGIRI visait à étudier l'intérêt d'un traitement de seconde ligne associant le regorafenib à l'irinotecan en
comparaison à l'irinotecan seul chez des patients atteints d'un cancer gastro-oesophagien métastatique en seconde ligne de traitement.
Notre laboratoire a déjà eu l'occasion de présenter les données de l'analyse des concentrations de l'ADN tunoral circulant chez les
patients lors du dernier congrès de l'ESMO (Harlé et al., ESMO Madrid 2023). Afin de compléter cette étude, nous souhaiterions
analyser les tumeurs des 35 patients inclus dans l'étude REGIRI afin de constituer les profils tumoraux et déterminer s'il existe une
signature génomique particulière qui pourrait être associée à une meilleure réponse ou une meilleure survie.
Afin de déterminer ces signatures, les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE) seront collectés, l'ADN extrait et
séquencé à l'aide d'un panel de plus de 500 gènes d'intérêt dans le cancer. Le traitement bioinformatique des données permettra de
déterminer si une signature génomique est associée à une meilleure réponse au traitement ou à une meilleure survie.
Environ 70 % des cas concernent les hommes : il existe un facteur 2 (incidence) et 3 (mortalité) entre les deux sexes.
L'adénocarcinome constitue aujourd'hui les deux tiers des cancers oesophagiens (contre un tiers pour les carcinomes à cellules
squameuses).
L'étude PRODIGE 68 REGIRI visait à étudier l'intérêt d'un traitement de seconde ligne associant le regorafenib à l'irinotecan en
comparaison à l'irinotecan seul chez des patients atteints d'un cancer gastro-oesophagien métastatique en seconde ligne de traitement.
Notre laboratoire a déjà eu l'occasion de présenter les données de l'analyse des concentrations de l'ADN tunoral circulant chez les
patients lors du dernier congrès de l'ESMO (Harlé et al., ESMO Madrid 2023). Afin de compléter cette étude, nous souhaiterions
analyser les tumeurs des 35 patients inclus dans l'étude REGIRI afin de constituer les profils tumoraux et déterminer s'il existe une
signature génomique particulière qui pourrait être associée à une meilleure réponse ou une meilleure survie.
Afin de déterminer ces signatures, les échantillons fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE) seront collectés, l'ADN extrait et
séquencé à l'aide d'un panel de plus de 500 gènes d'intérêt dans le cancer. Le traitement bioinformatique des données permettra de
déterminer si une signature génomique est associée à une meilleure réponse au traitement ou à une meilleure survie.
Mots clés :
cancer gastro-oesophagien, signature génomique
Département(s) :
| Biologie, Signaux et Systèmes en Cancérologie et Neurosciences |
Publications :
https://doi.org/10.1016/j.annonc.2023.09.1467 + CRAN - Publications
